Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
NCOA3Q9Y6Q9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NCOA3Q9Y6Q9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NCOA3Q9Y6Q9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NCOA3Q9Y6Q9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NCOA3Q9Y6Q9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
NCOA3Q9Y6Q9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
NCOA3Q9Y6Q9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NCOA3Q9Y6Q9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
NCOA3Q9Y6Q9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NCOA3Q9Y6Q9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
NCOA3Q9Y6Q9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NCOA3Q9Y6Q9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
NCOA3Q9Y6Q9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
NCOA3Q9Y6Q9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NCOA3Q9Y6Q9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.77■■■■□ 3
NCOA3Q9Y6Q9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
NCOA3Q9Y6Q9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NCOA3Q9Y6Q9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NCOA3Q9Y6Q9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NCOA3Q9Y6Q9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NCOA3Q9Y6Q9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NCOA3Q9Y6Q9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NCOA3Q9Y6Q9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
NCOA3Q9Y6Q9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NCOA3Q9Y6Q9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
NCOA3Q9Y6Q9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NCOA3Q9Y6Q9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NCOA3Q9Y6Q9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NCOA3Q9Y6Q9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NCOA3Q9Y6Q9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NCOA3Q9Y6Q9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NCOA3Q9Y6Q9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
NCOA3Q9Y6Q9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NCOA3Q9Y6Q9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NCOA3Q9Y6Q9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NCOA3Q9Y6Q9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NCOA3Q9Y6Q9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NCOA3Q9Y6Q9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms