Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL3Q9Y4R7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTLL3Q9Y4R7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL3Q9Y4R7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms