Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FARP1Q9Y4F1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FARP1Q9Y4F1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FARP1Q9Y4F1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms