Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIF3AQ9Y496 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIF3AQ9Y496 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KIF3AQ9Y496 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms