Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HCN4Q9Y3Q4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HCN4Q9Y3Q4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HCN4Q9Y3Q4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms