Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
TRAPPC8Q9Y2L5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TRAPPC8Q9Y2L5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
TRAPPC8Q9Y2L5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRAPPC8Q9Y2L5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TRAPPC8Q9Y2L5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TRAPPC8Q9Y2L5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TRAPPC8Q9Y2L5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms