Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIK3Q9Y2K2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK3Q9Y2K2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK3Q9Y2K2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms