Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMPQ9Y244 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POMPQ9Y244 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMPQ9Y244 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMPQ9Y244 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMPQ9Y244 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POMPQ9Y244 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POMPQ9Y244 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMPQ9Y244 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMPQ9Y244 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMPQ9Y244 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POMPQ9Y244 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMPQ9Y244 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMPQ9Y244 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POMPQ9Y244 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POMPQ9Y244 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POMPQ9Y244 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms