Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHMP2BQ9UQN3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMP2BQ9UQN3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHMP2BQ9UQN3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms