Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN8AQ9UQD0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN8AQ9UQD0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms