Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COPS3Q9UNS2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS3Q9UNS2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms