Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRQQ9UMZ3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRQQ9UMZ3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRQQ9UMZ3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRQQ9UMZ3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms