Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLEC4EQ9ULY5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLEC4EQ9ULY5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLEC4EQ9ULY5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms