Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV8

CBLC, E3 ubiquitin-protein ligase CBL-C, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLCQ9ULV8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBLCQ9ULV8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBLCQ9ULV8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBLCQ9ULV8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms