Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FZD4Q9ULV1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FZD4Q9ULV1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms