Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG6

CCPG1, Cell cycle progression protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCPG1Q9ULG6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCPG1Q9ULG6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCPG1Q9ULG6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCPG1Q9ULG6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms