Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
AMFRQ9UKV5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AMFRQ9UKV5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AMFRQ9UKV5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms