Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPREB3Q9UKI3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VPREB3Q9UKI3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPREB3Q9UKI3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms