Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBE1Q9UJT0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBE1Q9UJT0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBE1Q9UJT0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBE1Q9UJT0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBE1Q9UJT0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBE1Q9UJT0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBE1Q9UJT0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBE1Q9UJT0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBE1Q9UJT0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBE1Q9UJT0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBE1Q9UJT0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBE1Q9UJT0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBE1Q9UJT0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBE1Q9UJT0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBE1Q9UJT0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBE1Q9UJT0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBE1Q9UJT0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBE1Q9UJT0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBE1Q9UJT0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBE1Q9UJT0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBE1Q9UJT0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBE1Q9UJT0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBE1Q9UJT0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TUBE1Q9UJT0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBE1Q9UJT0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms