Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIC8

LCMT1, Leucine carboxyl methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT1Q9UIC8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LCMT1Q9UIC8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCMT1Q9UIC8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms