Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP25Q9UHP3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP25Q9UHP3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP25Q9UHP3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms