Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCF2Q9UG63 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCF2Q9UG63 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCF2Q9UG63 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms