Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLKQ9UBT6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLKQ9UBT6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLKQ9UBT6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLKQ9UBT6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
POLKQ9UBT6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
POLKQ9UBT6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
POLKQ9UBT6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
POLKQ9UBT6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
POLKQ9UBT6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
POLKQ9UBT6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
POLKQ9UBT6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
POLKQ9UBT6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
POLKQ9UBT6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
POLKQ9UBT6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
POLKQ9UBT6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
POLKQ9UBT6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
POLKQ9UBT6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
POLKQ9UBT6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
POLKQ9UBT6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
POLKQ9UBT6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
POLKQ9UBT6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
POLKQ9UBT6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
POLKQ9UBT6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
POLKQ9UBT6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
POLKQ9UBT6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
POLKQ9UBT6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
POLKQ9UBT6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
POLKQ9UBT6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
POLKQ9UBT6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
POLKQ9UBT6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms