Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
MBD5Q9P267 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
MBD5Q9P267 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
MBD5Q9P267 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
MBD5Q9P267 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
MBD5Q9P267 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
MBD5Q9P267 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
MBD5Q9P267 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
MBD5Q9P267 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
MBD5Q9P267 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
MBD5Q9P267 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
MBD5Q9P267 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
MBD5Q9P267 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
MBD5Q9P267 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
MBD5Q9P267 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
MBD5Q9P267 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36.41■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.42
MBD5Q9P267 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
MBD5Q9P267 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.27■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
MBD5Q9P267 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
MBD5Q9P267 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms