Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMOD2Q9NZR1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TMOD2Q9NZR1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMOD2Q9NZR1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TMOD2Q9NZR1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMOD2Q9NZR1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMOD2Q9NZR1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TMOD2Q9NZR1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD2Q9NZR1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMOD2Q9NZR1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMOD2Q9NZR1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
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