Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY99

SNTG2, Gamma-2-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG2Q9NY99 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNTG2Q9NY99 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNTG2Q9NY99 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNTG2Q9NY99 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms