Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VNN3Q9NY84 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms