Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMPD4Q9NXE4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMPD4Q9NXE4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMPD4Q9NXE4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPD4Q9NXE4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPD4Q9NXE4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPD4Q9NXE4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPD4Q9NXE4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms