Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED29Q9NX70 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED29Q9NX70 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED29Q9NX70 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED29Q9NX70 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED29Q9NX70 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED29Q9NX70 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.33■■□□□ 1
MED29Q9NX70 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MED29Q9NX70 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED29Q9NX70 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED29Q9NX70 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED29Q9NX70 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED29Q9NX70 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED29Q9NX70 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED29Q9NX70 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED29Q9NX70 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED29Q9NX70 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MED29Q9NX70 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED29Q9NX70 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED29Q9NX70 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED29Q9NX70 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED29Q9NX70 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED29Q9NX70 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MED29Q9NX70 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MED29Q9NX70 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED29Q9NX70 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED29Q9NX70 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED29Q9NX70 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MED29Q9NX70 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MED29Q9NX70 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED29Q9NX70 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED29Q9NX70 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MED29Q9NX70 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MED29Q9NX70 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED29Q9NX70 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MED29Q9NX70 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED29Q9NX70 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MED29Q9NX70 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MED29Q9NX70 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED29Q9NX70 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MED29Q9NX70 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED29Q9NX70 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED29Q9NX70 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MED29Q9NX70 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED29Q9NX70 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MED29Q9NX70 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED29Q9NX70 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MED29Q9NX70 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED29Q9NX70 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED29Q9NX70 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MED29Q9NX70 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED29Q9NX70 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED29Q9NX70 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MED29Q9NX70 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED29Q9NX70 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED29Q9NX70 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MED29Q9NX70 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED29Q9NX70 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.7 ms