Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL2Q9NX52 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL2Q9NX52 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms