Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWK9

ZNHIT6, Box C/D snoRNA protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT6Q9NWK9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNHIT6Q9NWK9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNHIT6Q9NWK9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNHIT6Q9NWK9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNHIT6Q9NWK9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNHIT6Q9NWK9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNHIT6Q9NWK9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ZNHIT6Q9NWK9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNHIT6Q9NWK9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNHIT6Q9NWK9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNHIT6Q9NWK9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNHIT6Q9NWK9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNHIT6Q9NWK9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNHIT6Q9NWK9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNHIT6Q9NWK9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNHIT6Q9NWK9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms