Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD3AQ9NVI7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATAD3AQ9NVI7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATAD3AQ9NVI7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms