Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPTLC3Q9NUV7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPTLC3Q9NUV7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms