Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC39A9Q9NUM3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC39A9Q9NUM3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms