Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJB4Q9NTQ9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJB4Q9NTQ9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJB4Q9NTQ9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJB4Q9NTQ9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJB4Q9NTQ9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms