Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD18Q9NS91 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD18Q9NS91 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD18Q9NS91 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms