Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HELLSQ9NRZ9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HELLSQ9NRZ9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HELLSQ9NRZ9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms