Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SERINC1Q9NRX5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERINC1Q9NRX5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERINC1Q9NRX5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms