Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BIN3Q9NQY0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BIN3Q9NQY0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BIN3Q9NQY0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms