Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX7

ITM2C, Integral membrane protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2CQ9NQX7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITM2CQ9NQX7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITM2CQ9NQX7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITM2CQ9NQX7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITM2CQ9NQX7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms