Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SEC31BQ9NQW1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SEC31BQ9NQW1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEC31BQ9NQW1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEC31BQ9NQW1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEC31BQ9NQW1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEC31BQ9NQW1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEC31BQ9NQW1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SEC31BQ9NQW1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SEC31BQ9NQW1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SEC31BQ9NQW1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SEC31BQ9NQW1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SEC31BQ9NQW1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SEC31BQ9NQW1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SEC31BQ9NQW1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SEC31BQ9NQW1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEC31BQ9NQW1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEC31BQ9NQW1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEC31BQ9NQW1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEC31BQ9NQW1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms