Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ASCL3Q9NQ33 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ASCL3Q9NQ33 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ASCL3Q9NQ33 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASCL3Q9NQ33 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms