Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TUFT1Q9NNX1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUFT1Q9NNX1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms