Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ERVK-5Q9HDB9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVK-5Q9HDB9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVK-5Q9HDB9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVK-5Q9HDB9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVK-5Q9HDB9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms