Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDFQ9HBH1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDFQ9HBH1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDFQ9HBH1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms