Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CLK4Q9HAZ1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK4Q9HAZ1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms