Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S0

NANOG, Homeobox protein NANOG, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGQ9H9S0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NANOGQ9H9S0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NANOGQ9H9S0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms