Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C8orf33Q9H7E9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C8orf33Q9H7E9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C8orf33Q9H7E9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C8orf33Q9H7E9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C8orf33Q9H7E9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C8orf33Q9H7E9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C8orf33Q9H7E9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C8orf33Q9H7E9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C8orf33Q9H7E9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C8orf33Q9H7E9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C8orf33Q9H7E9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C8orf33Q9H7E9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C8orf33Q9H7E9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C8orf33Q9H7E9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C8orf33Q9H7E9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C8orf33Q9H7E9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C8orf33Q9H7E9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C8orf33Q9H7E9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C8orf33Q9H7E9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C8orf33Q9H7E9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C8orf33Q9H7E9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C8orf33Q9H7E9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C8orf33Q9H7E9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C8orf33Q9H7E9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms