Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EBF3Q9H4W6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EBF3Q9H4W6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EBF3Q9H4W6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EBF3Q9H4W6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms