Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4M9

EHD1, EH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1Q9H4M9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EHD1Q9H4M9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EHD1Q9H4M9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms